生物质科学与工程研究院主要依托河南工业大学食品科学与工程、化学和生物学三个一级学科开展跨学科的科学研究和招生工作，并依托三个学科成立了3个科研中心，分别为生物质资源化工前沿研究中心、木本油料新资源挖掘与高值化利用研究中心、生物质资源生物高值转化与利用中心；4个校级创新团队，分别为物质能源与材料创新团队、化工过程强化创新团队、油料资源精深加工创新团队和生物转化技术创新团队。

（1）食品科学与工程学科

食品科学与工程学科源于1959年成立的郑州粮食学院，设立油脂工程、粮油储藏、食品工程方向，拥有学士、硕士、博士在内的完整人才培养体系，建有食品科学与工程博士后流动站。2007年获批国家级特色专业，2009年获批“一本”招生，2012年、2016年和2020年三次通过中国工程教育专业认证，2020年获批国家级一流本科专业建设点、河南省特色骨干建设学科，2021年被遴选为河南省“双一流”创建学科，2022年获批河南省“双一流”创建学科。支撑的农业科学学科进入ESI全球前2‰，第五轮学科评估获得B+，入选教育部“优先发展学科”。

（2）化学学科

化学学科是河南省一级重点学科，进入ESI全球排名前1%，迈入国际高水平学科行列。化学工程与技术学科是河南省一级重点学科、河南省优势特色学科。通过冷却、结晶、分提对油脂进行精炼、提纯和分离、功能化离子液体对食品基质中有机污染物的微萃取、植物油中有害成分分析方面在河南省居领先地位，在国内具有一定知名度。基本形成了以工为主、理工结合、优势互补、协调发展的以生物质资源化学化工为特色的优势特色学科。

（3）生物学学科

河南工业大学生物学是河南省一级重点学科，在原郑州粮食学院生物化学教研室、粮食微生物学教研室基础上发展起来，在上世纪80年代即开始培养农产品加工与贮藏方向的研究生。2006年学院获批获微生物学硕士点，2008年微生物学被评为河南省重点学科，2010年获批生物学一级硕士点。2012年“工业微生物菌种保藏与选育”河南省工程实验室和“农产品产后微生物检测与防控”河南省高校重点实验室培育基地立项建设，同年“生物学”被评为河南省第七批重点学科。2015年，生物学参与“粮食产后加工与安全”河南省特色学科群建设，2021年，获得小麦生物加工与营养功能河南省重点实验室立项建设。2022年，生物技术本科专业被评为国家一流专业建设点，生物工程本科专业通过国家工程教育认证。经过多年的建设和发展，形成了理、工、农结合,以工为主的特色生物学科，在国内外同行中享有较高的声誉。